Você pode achar estranho quando faz um download pelo eMuPlus e ,usando o Sistema Operacional WindowsVista não o encontra na pasta: C:\Arquivos de Programa\eMule\Incoming. Aqui vai a solução:
Para localizar o arquivo que você baixou entre neste caminho:
C:\Users\"seu nome no PC"\AppData\Local\VirtualStore\Program Files\eMule
Neste local você encontrará sua pasta Incoming com seus downloads.
Para facilitar o acesso a seus downloads crie uma pasta em um local de fácil acesso Exemplo:
Uma pasta em C:\Users\Boo.
Com o nome Emule, abra o EmulePlus clique em Preferencias/Geral/Diretórios, e mude o caminho dos Arquivos Recebidos para esta pasta que criou. Aplique a configuração e pronto resolvido o problema todos os seus arquivos baixados vão estar em C:\Users\Boo\Emule.
A 2ª opção é ir lá na Pasta Incoming (mesmo vazia) e clicar no botão "Abrir Arquivos de Compatibilidade". Os arquivos vão aparecer.
Espero ter ajudado :D